1960 год. В столице Советского Союза, Москве, фиксируется вспышка чёрной оспы — болезни, которая считается смертельной и неизлечимой, хотя в СССР её давно признали ликвидированной. Чтобы предотвратить возможную эпидемию, КГБ поручает это дело полковнику Шилову. Он незамедлительно приступает к расследованию, поскольку у него с оспой свои давние счёты. Цель — выявить всех инфицированных и остановить распространение вируса. Однако задача оказывается крайне сложной. Инфекция просочилась в теневую сторону жизни города: в среду фарцовщиков, подпольных тотализаторов, проституции и наркотиков. Шилов вынужден искать разгадку в самых тёмных уголках преступного мира, вытаскивая на поверхность его обитателей и их тайны.